微生物对循环冷却水系统的危害主要是其所产生的黏泥造成的，具体对系统的影响如下：

（1）微生物的黏附特性促进污垢沉积 一般认为水垢和污垢形成的过程可分为盐的结晶、聚合和沉积三步。水中难溶盐的浓度达到过饱和时，不一定立即沉积在设备上，而是先在水中形成细小的悬浮晶粒。水中的胶体物质、微生物黏泥、悬浮物、腐蚀产物等能起架桥、絮凝作用使晶粒长大，再借重力作用沉降到设备上，并黏附成垢。微生物的黏着性使其起了黏合剂的作用，促进了污垢沉积。所以，微生物数量多和黏泥含量高的系统，更容易形成污垢。

（2）黏泥附着易造成严重的局部腐蚀 黏泥附着最严重的危害在于因垢下缺氧而产生的电化学腐蚀，即垢下腐蚀。这种腐蚀是非均匀性的，往往高度集中于局部部位，腐蚀速度快，容易使换热管穿孔，甚至报废。

（3）黏泥附着影响传热 黏泥附着使换热器的污垢热阻值增加，换热效率降低，工艺介质超温，生产能耗增加，严重时会影响产量。水垢附着虽也影响传热，但其结垢速度比黏泥附着速度慢得多，影响也略低。

（4）影响浓缩倍数提高 系统在黏泥危害期间需要大量排污以降低水中黏泥含量，使系统的浓缩倍数不容易提高，既浪费水资源，又浪费了缓蚀阻垢药剂。