所有杀生剂不仅都有毒性，而且均为危险化学品，能给人的身体带来伤害。以氯为例，有强烈的刺激臭味和腐蚀性，有剧毒，特别对呼吸器官有刺激作用，并刺激黏膜导致眼睛流泪，使眼、鼻、咽部有烧灼、刺痛和窒息感。吸入后可引起恶心、呕吐、上腹痛、腹泻等症状。吸入过多甚至可能死亡。除氯之外，溴、氯化溴、二氧化氯、臭氧、过氧化氢和丙烯醛也具有强刺激性和毒性，其导致的症状也与氯相似。

次氯酸盐能使皮肤烧伤，黏膜腐蚀，食管、气管穿孔，喉部水肿，支气管灼烧，肺水肿。溴氯二甲基海因（BCDMH）对皮肤、眼睛有强烈刺激。几乎所有常用的非氧化性杀生剂对皮肤、眼睛及呼吸系统都有不同程度的刺激性，如双（氧化三丁基锡）、戊二醛、二硫氰酸甲酯、季?盐、二溴次氨基丙酰胺、异噻唑啉酮、季铵盐等。为此在处理和使用杀生剂时需非常小心，特别注意防止皮肤、眼睛和呼吸系统受到伤害。应穿着遮盖手臂、腿部的衣物，戴橡皮手套及护目镜。为防止氯气之类泄漏等事故，应配有呼吸设备。

部分杀生剂可能对人体的伤害（国外资料）

注：“＋”号表示可能造成的伤害。

在冷却塔集水池的污泥中含有大量微生物及其吸附的丰富的杀生剂。在厌气条件下，杀生剂因难被分解而积累增多。当人工清池时，也会对皮肤造成伤害，如发炎、起泡。故清池人员的穿着需能保护皮肤。

为了操作人员的安全，在选用每种杀生剂之前必须了解杀生剂的毒害性能及其对策，准备必要的劳动保护设施，制定好安全操作规程。在事事有准备的情况下，安全防护是有保障的。