生化处理是利用微生物，将废水中部分或大部分的有机物氧化分解成无机物，使废水得到净化。主要的方法有：

（1）活性污泥法 又称好氧生物处理法。在曝气供氧条件下，絮凝体的生物污泥和被处理废水相接触，利用活性污泥去除废水的有机污染物。此时的微生物是悬浮生长的。

（2）生物膜法 利用附着在固体（载体）表面上的微生物膜，废水通过后，微生物膜氧化分解以去除废水中的有机污染物，有生物滤池、生物转盘、接触氧化法等法。此时的微生物主要是附着生长的。

（3）厌氧生物法 普通厌氧池和厌氧接触池、两相厌氧池、厌氧滤池、厌氧流化床等。

（4）生物塘法 需氧塘、兼性塘、厌氧塘、曝气塘等。

（5）自然生物处理土地处理系统 利用土壤中的微生物和植物对污水污染物的综合净化能力来处理废水，利用其中的肥分和水分来促进农作物等的生长，并净化废水。

根据废水处理过程中，起主要作用的微生物对于氧气要求的不同，生化处理的方法总体上可分为好氧生物处理和厌氧生物处理两大类。