除盐水中的胶体硅一旦进入锅炉，在高温高压的作用下，会转化为活性硅，在锅炉和蒸汽系统形成硅垢。因此，胶体硅的去除十分重要。经测定，澄清池除胶体硅的效率可达50％～80％，过滤除硅能力达10％～20％，而复床和混合床除硅都不到5％。因此，除硅应当以澄清池为主。

由于胶体硅的颗粒十分微小，粒径约10^－6～10^－5 mm；表面常有负电的胶粒存在，其自然沉降速度十分缓慢，每秒钟只有10?（1nm），因而靠自然沉降除胶体硅是不可能的。因此，必须根据胶体物质的特性，在水中加入一种带正电胶体的高价离子，或利用增大水溶液中盐类浓度等方法，使其发生电中和，降低胶体硅的吸附层和水溶液间的电位差。为达到此目的，一般是在水的澄清处理中，加入一定量的带正电荷的混凝剂胶体如Al（OH）₃、Fe（OH）₃，或加入镁剂如MgO，与胶体硅异电相吸，聚凝成大颗粒，藉其重量由沉淀而除去。据试验，除硅处理的混凝剂投加量为40～60mg/L；对于MgO加量，其估算方法是每去除1份SiO^2－₃约加15份MgO量。