由于水中离子在膜中的迁移速度大于在水溶液中的迁移速度，而且，淡室膜面上离子的浓度，也总是低于溶液中的浓度。如果电流密度越高，浓度差也越大，当电流密度上升到某一数值时，膜面上的离子浓度会低到零，这时发生膜面上大量水的电解现象，称为极化现象。

电渗析过程中产生的浓差极化，会产生很多不利因素和危害如下：

  1. 电阻增大，电流下降，除盐率下降；
  2. 浓水和淡水的pH发生变化，常称之为中性扰乱；
  3. 电流效率下降；
  4. 膜表面上出现沉淀或结垢，这主要在阴膜的浓水室一侧。

由于极化，淡水室的OH－富集在阴膜浓水一侧，因此这滞流层内溶液的pH值变大，呈碱性。同时，淡水室内的阴离子HCO－3、SO2－4等迁过阴膜，也富集在这里，还有浓水室中的硬度离子也被阻挡在这滞流层中，这样当这些正负离子的离子积大于它们组成Mg（OH）2、CaCO3或CaSO4的溶度积时，就在阴膜浓水室一侧滞流层内产生沉淀或污垢。

防止和消除极化沉淀，有下列方法：①极限电流法，要严格控制电渗析器的工作电流，始终低于产生极化时的极限电流，从而避免极化的产生；②倒换电极法，定时倒换电极，使离子的迁移方向改变，从而使浓、淡室也相应倒换，约2～4H倒极一次，这样，即使有轻微沉淀也会得到消除；③清洗法，定期用1％～2％浓度的盐酸循环清洗1H左右，并使沉淀物清除排出；④拆洗法，电渗析器经半年或一年运行之后，将装置拆开，把隔板和膜片等清洗干净。