氨污染是氮肥厂循环冷却水系统中微生物危害的特殊矛盾。经常性的水中含氨使NO^－₂及亚硝酸细菌增高，由此带动的微生物失控情况带有急性病的特点，困扰水处理工作者。一般认为NH^＋₄>10mg/L，NO^－₂>1mg/L时控制起来就有困难，认为应将其规定为控制指标。实际上泄漏多少氨，并不由水处理工作者的意志而定，定了指标也难执行。有的厂受环境影响甚至长期含氨量超过80mg/L，但可以控制得很好。许多氮肥厂的解决办法归纳如下：

（1）快速加氯 通氯杀生时，氯既要氧化NO^－₂，又要杀灭微生物。其在水中大致反应如下：

在水中游离余氯与NO^－₂不共存，氯必须先将NO^－₂全部氧化成NO^－₃之后才能产生游离余氯。也就是氯氧化NO^－₂的速度必须快于亚硝酸细菌产生NO^－₂的速度才能达到杀生目的。通氯时，水中的微生物还在繁殖，更由于水中还在不断漏氨，又在不断产生NO^－₂，所以必须快速加氯才能达到压倒NO^－₂产生游离余氯的目的。我们的目的并不是彻底消灭NO^－₂。事实上在氨污染时只能暂时消灭NO^－₂，一旦停氯，亚硝酸细菌又会繁殖，NO^－₂又会上升。我们所希望的只是在通氯期间NO^－₂短暂消失，利用此短暂的机会使微生物更多被杀灭，更快达到游离余氯指标。只有速战速决才能达到目的。

快速加氯的先决条件是加氯机的设计能力必须足够大。加氯机能力小时对微生物失控的情况完全无力解决。有的不得不全日连续通氯，但游离余氯仍不达标，有时甚至几个月游离余氯为零。像这样通氯，实际上是打氯的消耗战，氯和NO^－₂处于相持状态，既消耗了氯，又使水中氯离子大量增加，更没能有效杀生。所以氮肥厂必须加大加氯机能力。由于各厂应对氨的能力不同，效果也不同。有的经常含氨80mg/L以上，因为有足够的加氯能力，NO^－₂常<0.5mg/L，微生物、黏泥量、COD都在正常范围。有的经常含氨<10mg/L，但往往NO^－₂>1.0mg/L，微生物、黏泥量、COD也有时超标。

以上以氯为例说明用氧化性杀生剂解决氨污染危害时的原则，即大剂量、快速，宜速战速决，不打消耗战。如采用其他氧化性杀生剂也应采用同样原则。有些厂采用次氯酸盐或漂白粉来解决氨污染问题，效果也很好。

（2）使用非氧化性杀生剂 非氧化性杀生剂与氧化性杀生剂作用机理不同，它不与NO^－₂作用，可以绕开NO^－₂直接杀灭各种微生物，使各种菌数、黏泥量、COD、浑浊度都下降。由于亚硝酸细菌大部分被消灭，NO^－₂含量也随之下降。这种方法效果明显，各种非氧化性杀生剂均可选用。因为费用高，所以一般在微生物失控状态下作救急用。待水质出现好转，NO^－₂下降之后，日常仍恢复氯杀生。

（3）加强监测，控制泄漏 结合氮肥厂的特点，除需监测微生物的数量和黏泥量之外，还应加强监测必要的化学项目。如分析水中的氨、亚硝酸根及化学需氧量COD，这些项目分析起来比分析细菌快速，能更快反映氨危害的趋势，便于及时采取杀生措施；应列入经常分析项目，每周分析一次。如发现氨泄漏，则加大分析频率，NH^＋₄和NO^－₂每日分析一次。有的厂在发现NH^＋₄>10mg/L或NO^－₂>1mg/L时，就每日分析一次。发现漏氨后尽快对全系统进行调查，直到查清是哪一台或哪几台水冷却器泄漏。查清之后，应尽可能争取系统停车的机会更换或修复。如果暂时没有停车机会，可以采取临时性的就地排污措施。即将在冷却塔的排污口关闭，临时在泄漏水冷却器的水出口排污。这样可减少泄漏的氨返回系统，以减轻氨污染的危害。